L'année 1999 où Elie avait de nombreux projets comme celui de sortir un single de l'été avec la voix de la fameuse Madame Sarfati, est une année noire pour le monde du rire. En effet, Elie Kakou s'en va le jeudi 10 juin 1999 au matin à l'âge de 39 ans d'un cancer du poumon à son domicile parisien.

Il disparaît dans la force de l'âge, laissant des admirateurs choqués par cette disparition si brutale. A l'annonce de sa mort, nombreux sont les témoignages d'amour et de fidélité qui paraissent. Catherine Trautmann dira cette très belle phrase: "Avec la disparition si prématurée d'Elie Kakou, nous perdons l'un des humoristes les plus talentueux de sa génération, une personnalité étonnante qui, au cinéma, à la télévision comme sur scène, avait su s'imposer auprès des publics les plus larges et les plus diversifiés. Passé maître dans l'art si difficile de faire rire, il savait aussi, comme tous les grands comiques, faire naître d'un rien les plus belles émotions". "Je ne veux pas être une star ..." disait-il en se moquant dans un de ses sketchs, et pourtant Elie Kakou était une star qui avec son départ nous laisse bien triste... Au revoir Elie, tu nous manques...